Разрушаване на клетъчната структура

Каспазата може директно да разруши клетъчната структура, като например разделяне на слоя ядрени влакна. Слоят от ядрени влакна (Lamina) е полимер, свързан глава с опашка чрез полимеризацията на протеина на слоя от ядрени влакна, като по този начин се образува скелетната структура на ядрената мембрана, така че хроматинът да може да се формира и подреди нормално. В процеса на клетъчна апоптоза, ламининът, като субстрат, се разцепва от каспаза на фиксирана позиция близо до средата, което води до разпадане на ламинин и кондензация на клетъчния хроматин.